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| 产地 | 美国 |
| 品牌 | 安捷伦 |
| 货号 | 5191-4079 |
| 用途 | 酶切片段化 |
| 包装规格 | 16 reactions |
| CAS编号 | |
| 纯度 | % |
| 是否进口 |
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安捷伦 SureSelect酶切片段化试剂盒
产品名称：SureSelect enzymatic fragmentation kit, 16 reactions
产品货号：5191-4079
适用于DNA起始量在10ng-200ng之间的各种GC含量、不同样本类型（血液、新鲜冷冻组织和FFPE），推荐在37摄氏度酶解15分钟。
酶裂解的热循环程序
步骤 | 温度 | 时间 |
1 | 37℃ | 见下表 |
2 | 65℃ | 5min |
3 | 4℃ | Hold |
碎片持续时间基于样本类型和NGS读取长度
NGS read 长度 | 目标片段的大小 | 持续时间为37℃ | |
高质量的DNA样本 | FFPE DNA样本 | ||
2X100 | 150-200bp | 15min | 15min |
2X150 | 180-250bp | 10 min | 15min |
1.准备基因组DNA样本并分析其质量
文库制备方案要求输入10 ng到200 ng的gDNA，初始DNA样品体积为7 ul，用于酶促DNA损伤对于某些FFPE样品，DNA输入量或定量方法可能需要调整。如下详细。为了获得*的测序结果，在推荐范围内使用*数量的DNA输入
2.从新鲜生物样品中制备高质量的Gdna
采用合适的纯化系统，如Qiagen's QIAamp DNA迷你试剂盒，按照制造商的协议进行纯化准备请注意确保基因组DNA样本质量高，OD为260/280范围从1.8到2.0.使用Oubit BR dsDNA检测试剂盒测定每个gDNA样品的浓度。按照制造商对仪器和检测试剂盒的说明操作从新鲜生物样本中提取的DNA不需要额外的DNA样本鉴定。
3.从FFPE样品中制备和鉴定gDNA
使用Qiagen's QIAamp DNA FFPE组织试剂盒和Qiagen’s QIAamp DNA FFPE Tissue Kit，按照制造商的协议从FFPE组织切片中制备gDNA。分两轮洗脱MinElute柱上的fina gDNA样品，每轮使用30 ul缓冲液ATE。最终洗脱体积约为60 ul。
请注意如果组织在蛋白酶K消化一小时后出现不完全裂解。加入另外10 ul的蛋白酶K，在56℃继续孵育。周期性的混合，持续3个小时。
将gDNA样本保存在冰中，以便当天文库准备，或在-20℃保存以备日后处理。
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| 货号 | 品名 |
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| G2991AA | 4200 TapeStation 系统 |
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| G9700B | Agilent NGS FFPE QC, 96 samples |
| 5191-4079 | SureSelect enzymatic fragmentation kit, 16 reactions |
| 5191-4080 | SureSelect enzymatic fragmentation kit, 96 reactions |
| G9682A | SureSelectQXT Library Prep Kit, ILM, 16 |
| G9682B | SureSelectQXT Library Prep Kit, ILM, 96 |
| G9611B | SureSelectXT Reagent kit, HSQ, 96 |
| G9611A | SureSelectXT Reagent kit, HSQ, 16 |
| G9703A | SSEL XT Low Input Reagent Kit (1-96) |
| G9703B | SSEL XT Low Input Reagent Kit (97-192) |
| G9702A | SSEL XT HS Reagent Kit (1-16), 16rxn |
| G9702C | SSEL XT HS Reagent Kit (1-32), 96rxn |
| G9981A | SureSelect XT HS2 DNA reagent kit with index primer pairs 1–16, 16 reactions |
| G9983A | SureSelect XT HS2 DNA reagent kit with index primer pairs 1–96, 96 reactions |
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